| 拉丁文学名 | 中文种名 |
| A.1 第一级:免作毒理学试验的菌种 | |
| A.1.1 根瘤菌类 | |
| Azorhizobium caulinodans | 田菁固氮根瘤菌—新增菌种 |
| Azorhizobium doebereinerae | 德式固氮根瘤菌—新增菌种 |
| Bradyrhizobium betae | 甜菜慢生根瘤菌—新增菌种 |
| Bradyrhizobium elkanii | 埃氏慢生根瘤菌 |
| Bradyrhizobium japonicum | 日本慢生根瘤菌(大豆慢生根瘤菌) |
| Bradyrhizobium liaoningense | 辽宁慢生根瘤菌(慢生大豆根瘤菌) |
| Bradyrhizobium sp.(Arachis hypogaea) | 花生根瘤菌—新增菌种 |
| Bradyrhizobium sp.(Vigna radiata) | 绿豆根瘤菌—新增菌种 |
| Bradyrhizobium yuanmingense | 圆明园慢生根瘤菌—新增菌种 |
| Bradyrhizobium diazoefficiens | 有效慢生根瘤菌(高效固氮慢生根瘤菌)—新增菌种 |
| Mesorhizobium huakuii | 华癸中间根瘤菌 |
| Mesorhizobium loti | 百脉根中间根瘤菌 |
| Rhizobium etli | 豆根瘤菌(埃特里根瘤菌)--重新规范命名 |
| Rhizobium fabae | 蚕豆根瘤菌—新增菌种 |
| Rhizobium galegae | 山羊豆根瘤菌—新增菌种 |
| Rhizobium leguminosarum | 豌豆根瘤菌—新增菌种 |
| Sinorhizobium fredii | 弗氏中华根瘤菌(快生大豆根瘤菌) |
| Sinorhizobium meliloti | 苜蓿中华根瘤菌 |
| 还包括尚未确定种名的,从一些豆科植物根瘤内分离、纯化、鉴定、回接、筛选后在原宿主植物结瘤、固氮良好的根瘤菌。 |
| A.1.2 自生及联合固氮微生物类 | |
| Azorhizophilus paspali(Azotobacter paspali ) | 雀稗固氮嗜根菌(雀稗固氮菌)--重新规范命名 |
| Azospirillum brasilense | 巴西固氮螺菌 |
| Azospirillum lipoferum | 具脂固氮螺菌(生脂固氮螺菌)--重新规范命名 |
| Azotobacter beijerinckii | 拜氏固氮菌 |
| Azotobacter chroococcum | 圆褐固氮菌(褐球固氮菌)--重新规范命名 |
| Azotobacter vinelandii | 瓦恩兰德固氮菌(棕色固氮菌)--重新规范命名 |
| Beijerinckia indica | 印度拜叶林克氏菌--重新规范命名 |
| A.1.3 光合细菌类 | |
| Blastochloris viridis(Rhodopseudomonas viridis) | 绿色绿芽菌(绿色红假单胞菌)--重新规范命名 |
| Phaeospirillum fulvum(Rhodospirillum fulvum) | 黄褐棕色螺旋菌(黄褐红螺菌)--重新规范命名 |
| Rhodobacter azotoformans | 固氮红细菌—新增菌种 |
| Rhodobacter capsulatus(Rhodopseudomonas capsulata) | 荚膜红细菌(荚膜红假单胞菌)--重新规范命名 |
| Rhodobacter sphaeroides (Rhodopseudomonas sphaeroides) | 类球红细菌(类球红假单胞菌)--重新规范命名 |
| Rhodoblastus acidophilus(Rhodopseudomonas acidophila) | 嗜酸红芽菌(嗜酸红假单胞菌)--重新规范命名 |
| Rhodopila globiformis(Rhodopseudomonas globiformis) | 球形红球形菌(球形红假单胞菌)--重新规范命名 |
| Rhodopseudomonas palustris(Rhodopseudomonas rutila) | 沼泽红假单胞菌(血红红假单胞菌) |
| Rhodospirillum rubrum | 深红红螺菌 |
| Rhodovibrio salinarum(Rhodospirillum salinarum) | 盐场玫瑰弧菌(盐场红螺菌)--重新规范命名 |
| Rhodovulum sulfidophilum(Rhodobacter sulfidophilus,Rhodopseudomonas sulfidophila) | 嗜硫小红卵菌(嗜硫红细菌,嗜硫红假单胞菌 )--新增菌种 |
| Rubrivivax gelatinosus (Rhodocyclus gelatinosus,Rhodopseudomonas gelatinosa) | 胶状红长命菌(胶状红环菌,胶状红假单胞菌)--重新规范命名 |
| A.1.4 促生、分解磷钾化合物细菌类 | |
| Acidithiobacillus thiooxidans(Thiobacillus thiooxidans) | 硫氧化酸硫杆状菌 (硫氧化硫杆菌)--重新规范命名 |
| Bacillus amyloliquefaciens | 解淀粉芽孢杆菌 |
| Bacillus coagulans | 凝结芽孢杆菌 –安全分级调整,由2级调整为1级 |
| Bacillus firmus | 坚强芽孢杆菌—新增菌种 |
| Bacillus licheniformis | 地衣芽孢杆菌 |
| Bacillus megaterium | 巨大芽孢杆菌 |
| Bacillus methylotrophicus | 甲基营养型芽孢杆菌—新增菌种 |
| Bacillus mycoides | 蕈状芽孢杆菌—新增菌种 |
| Bacillus pumilus | 短小芽孢杆菌–安全分级调整,由2级调整为1级 |
| Bacillus safensis | 沙福芽孢杆菌—新增菌种 |
| Bacillus simplex | 简单芽孢杆菌—新增菌种 |
| Bacillus subtilis | 枯草芽孢杆菌 |
| Brevibacillus brevis(Bacillus brevis) | 短短芽孢杆菌(短芽孢杆菌)--重新规范命名,安全分级调整,由2级调整为1级 |
| Brevibacillus laterosporus | 侧孢短芽孢杆菌--重新规范命名 |
| Geobacillus stearothermophilus | 嗜热嗜脂肪地芽孢杆菌(嗜热脂肪地芽孢杆菌)–安全分级调整,由2级调整为1级 |
| Paenibacillus azotofixans(Paenibacillus durus) | 固氮类芽孢杆菌 |
| Paenibacillus mucilaginosus | 胶冻样类芽孢杆菌--重新规范命名 |
| Paenibacillus peoriae | 皮尔瑞俄类芽孢杆菌—新增菌种 |
| Paenibacillus polymyxa | 多粘类芽孢杆菌 |
| A.1.5 乳酸菌类 | |
| Lactobacillus acidophilus | 嗜酸乳杆菌 |
| Lactobacillus brevis | 短乳杆菌—新增菌种 |
| Lactobacillus buchneri | 布氏乳杆菌 –新增菌种 |
| Lactobacillus casei | 干酪乳杆菌 |
| Lactobacillus delbrueckii | 德氏乳杆菌—保加利亚乳杆菌是其亚种 |
| Lactobacillus helveticus | 瑞士乳杆菌—新增菌种 |
| Lactobacillus parabuchneri | 类布氏乳杆菌 |
| Lactobacillus paracasei | 类干酪乳杆菌—新增菌种 |
| Lactobacillus plantarum | 植物乳杆菌—新增菌种 |
| Lactobacillus rhamnosus | 鼠李糖乳杆菌—新增菌种 |
| Lactococcus lactis(Streptococcus lactis) | 乳酸乳球菌(乳酸链球菌)--重新规范命名 |
| Pediococcus pentosaceus | 戊糖片球菌—新增菌种 |
| Streptococcus thermophilus | 嗜热链球菌 |
| A.1.6 酵母菌类 | |
| Candida ethanolica | 乙醇假丝酵母—新增菌种 |
| Candida membranifaciens | 膜醭假丝酵母 |
| Cyberlindnera fabianii(Pichia fabianii) | 费比恩塞伯林德纳氏酵母(费比恩毕赤酵母)--新增菌种 |
| Cyberlindnera jadinii(Candida utilis,Pichia jadinii) | 杰丁塞伯林德纳氏酵母(产朊假丝酵母,杰丁毕赤酵母 )--重新规范命名 |
| Issatchenkia orientalis(Candida krusei) | 东方伊萨酵母—新增菌种 |
| Kazachstania exigua(Saccharomyces exiguus) | 少孢哈萨克斯坦酵母(少孢酵母)--新增菌种 |
| Kluyveromyces lactis | 乳酸克鲁维酵母—新增菌种 |
| Komagataella pastoris (Pichia pastoris) | 巴斯德驹田氏酵母(巴斯德毕赤酵母)--新增菌种 |
| Meyerozyma guilliermondii(Candida guillermondii,Pichia guilliermondii) | 季也蒙迈耶氏酵母(季也蒙假丝酵母,季也蒙毕赤酵母)--重新规范命名 |
| Millerozyma farinosa(Pichia farinosa) | 粉状米勒氏酵母(粉状毕赤酵母 )--重新规范命名 |
| Pichia membranifaciens | 膜醭毕赤酵母 |
| Rhodotorula mucilaginosa (Rhodotorula rubra ) | 胶红酵母(深红酵母 ) --重新规范命名 |
| Saccharomyces cerevisiae | 酿酒酵母 |
| Saccharomycopsis fibuligera(Endomycopsis fibuligera) | 扣囊复膜孢酵母(扣囊拟内孢霉)--新增菌种 |
| Wickerhamomyces anomalus(Pichia anomala) | 异常威克汉姆酵母(异常毕赤酵母)--新增菌种 |
| Yarrowia lipolytica(Candida lipolytica) | 解脂耶罗威亚酵母 (解脂假丝酵母)--新增菌种 |
| A.1.7 AM真菌类 | |
| Funneliformis mosseae(Glomus mosseae ) | 摩西管柄囊霉(摩西球囊霉)--重新规范命名 |
| Rhizophagus intraradices ( Glomus intraradices) | 根内根生囊霉(根内球囊霉)--新增菌种 |
| A.1.8放线菌类 | |
| Frankia sp. | 弗兰氏克菌(固氮放线菌) |
| Streptomyces fradiae | 弗氏链霉菌–安全分级调整,由2级调整为1级 |
| Streptomyces microflavus | 细黄链霉菌 |
| A.2 第二级:需做急性经口毒性(LD50)试验的菌种 | |
| Arthrobacter arilaitensis | 阿氏团队节杆菌(研究团队节杆菌)--新增菌种 |
| Arthrobacter aurescens | 变金黄节杆菌(金黄节杆菌)--新增菌种 |
| Aspergillus candidus | 亮白曲霉 |
| Aspergillus chevalieri (Eurotium chevalieri) | 谢瓦曲霉(谢瓦散囊菌)--重新规范命名 |
| Aspergillus japonicus | 日本曲霉—新增菌种 |
| Aspergillus niger | 黑曲霉 |
| Aspergillus oryzae | 米曲霉 |
| Aspergillus penicillioides | 帚状曲霉 |
| Aspergillus sydowii | 聚多曲霉 |
| Aspergillus wentii | 温特曲霉 |
| Bacillus atrophaeus | 萎缩芽孢杆菌—新增菌种 |
| Bacillus circulans | 环状芽孢杆菌 |
| Bacillus thuringiensis | 苏云金芽孢杆菌—安全分级调整,由1级调整为2级 |
| Brevundimonas vesicularis(Pseudomonas vesicularis) | 泡囊短波单胞菌(泡囊假单胞菌)--重新规范命名 |
| Chaetomium cochliodes | 螺卷毛壳 |
| Chaetomium globosum | 球毛壳 |
| Chaetomium trilaterale | 三侧毛壳 |
| Clonostachys rosea (Gliocladium roseum) | 粉红螺旋聚孢霉;粉红枝穗霉(粉红粘帚霉)--重新规范命名 |
| Clostridium pasteurianum | 巴氏梭菌(巴斯德梭菌)--重新规范命名 |
| Geotrichum candidum | 白地霉 |
| Hydrogenophaga flava | 黄色食氢产水嗜菌(黄色嗜氢菌)--新增菌种 |
| Laceyella sacchari | 糖莱西氏菌(甘蔗兰希氏菌)--新增菌种 |
| Lysinibacillus sphaericus(Bacillus sphaericus) | 球形赖氨酸芽孢杆菌(球形芽孢杆菌)--重新规范命名 |
| Myceliophthora thermophila(Sporotrichum thermophie) | 嗜热毁丝霉(嗜热侧孢霉)--重新规范命名 |
| Paenibacillus macerans | 浸麻类芽孢杆菌 |
| Penicillium albicans | 白色青霉—新增菌种 |
| Penicillium bilaiae | 拜赖青霉(比莱青霉)--新增菌种 |
| Penicillium citreonigrum | 黄暗青霉 |
| Penicillium corylophilum | 顶青霉 –新增菌种 |
| Penicillium euglaucum(Eupenicillium hirayamae) | 真灰绿青霉(平山正青霉)--新增菌种 |
| Penicillium expansum | 扩展青霉—新增菌种 |
| Penicillium glabrum(Penicillium frequentans) | 光孢青霉(常现青霉)--重新规范命名 |
| Penicillium oxalicum | 草酸青霉—新增菌种 |
| Phanerodontia chrysosporium(Phanerochaete chrysosporium) | 异原黄孢原毛平革菌(黄孢原毛平革菌)--新增菌种 |
| Promicromonospora citrea | 柠檬原小单胞菌 |
| Pseudomonas fluorescens | 荧光假单胞菌 |
| Pseudomonas putida | 恶臭假单胞菌 |
| Pseudomonas stutzeri | 施氏假单胞菌 |
| Purpureocillium lilacinum(Paecilomyces lilacinus) | 淡紫紫孢菌(淡紫拟青霉)--新增菌种 |
| Rhizopus nigricans | 黑根霉—新增菌种 |
| Rhizopus oryzae | 米根霉 |
| Sphingobacterium multivorum (Flavobacterium multivorum) | 多食鞘氨醇杆菌(多食黄杆菌) |
| Streptomyces albidoflavus | 白黄链霉菌(微白黄链霉菌)--重新规范命名 |
| Streptomyces albogriseolus | 白浅灰链霉菌—新增菌种 |
| Streptomyces alboniger | 白黑链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces albovinaceus | 白酒红链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces albus | 白色链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces avermitilis | 阿维菌素链霉菌(除虫链霉菌)--新增菌种 |
| Streptomyces cellulosae | 纤维素链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces corchorusii | 黄麻链霉菌--新增菌种 |
| streptomyces globisporus | 球孢链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces griseoincarnatus | 浅灰肉色链霉菌(灰肉红链霉菌)--新增菌种 |
| Streptomyces hiroshimensis (Streptomyces salmonis ) | 广岛链霉菌(鲑色链霉菌)--新增菌种 |
| Streptomyces lavendulae | 淡紫灰链霉--新增菌种 |
| Streptomyces pactum | 密旋链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces rochei | 娄彻链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces tendae | 唐德链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces thermoviolaceus | 热紫链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces venezuelae | 委内瑞拉链霉菌--新增菌种 |
| Streptomyces vinaceusdrappus | 酒红土褐链霉菌—新增菌种 |
| Streptomyces caelestis | 天青链霉菌—新增菌种 |
| Stretomyces canus | 暗灰链霉菌--新增菌种 |
| Stretomyces costaricanus | 哥斯达黎加链霉菌--新增菌种 |
| Trichoderma asperellum | 棘孢木霉--新增菌种 |
| Trichoderma atroviride | 深绿木霉--新增菌种 |
| Trichoderma ghanense | 加纳木霉--新增菌种 |
| Trichoderma harzianum | 哈茨木霉 |
| Trichoderma koningii | 康宁木霉 |
| Trichoderma longibrachiatum | 长枝木霉--新增菌种 |
| Trichoderma pseudokoningii | 拟康宁木霉--新增菌种 |
| Trichoderma reesei | 里氏木霉--新增菌种 |
| Trichoderma virens | 绿木霉--新增菌种 |
| Trichoderma viride | 绿色木霉 |
| A.3 第三级:需做致病性试验的菌种 | |
| Achromobacter denitrificans(Alcaligenes denitrificans) | 反硝化无色小杆菌(反硝化产碱菌)--重新规范命名 |
| Achromobacter xylosoxidans (Alcaligenes xylosoxidans) | 木糖氧化无色小杆菌(木糖氧化产碱菌)--重新规范命名 |
| Acinetobacter baumannii | 鲍氏不动杆菌 |
| Acinetobacter calcoaceticus | 乙酸钙不动杆菌 |
| Alcaligenes faecalis | 粪产碱菌 |
| Bacillus cereus | 蜡样芽孢杆菌 |
| Brevundimonas diminuta(Pseudomonas diminuta) | 缺陷短波单胞菌(缺陷假单胞菌) --重新规范命名 |
| Burkholderia fungorum | 真菌伯克霍尔德氏菌--安全分级调整,由2级调整为3级 |
| Enterobacter cloacae | 阴沟肠杆菌 |
| Enterobacter gergoviae | 日勾维肠杆菌 |
| Gordonia amarae(Nocardia amarae) | 沟戈登氏菌,污泥戈登氏菌(沟诺卡氏菌)--新增菌种 |
| Mucor circinelloides | 卷枝毛霉—新增菌种 |
| Nocardia sp. | 诺卡氏菌--安全分级调整,由2级调整为3级 |
| Nocardiopsis sp. | 拟诺卡氏菌--安全分级调整,由2级调整为3级 |
| Pantoea agglomerans(Enterobacter agglomerans) | 成团泛菌(成团肠杆菌)--重新规范命名 |
| Pseudomonas alcaligenes | 产碱假单胞菌—新增菌种 |
| Rhizobium radiobacter(Agrobacterium radiobacter, Agrobacterium tumefaciens) | 放射状根瘤菌(放射状农杆菌,根癌农杆菌)--新增菌种 |
| Proteus sp. | 变形菌 |
| A.4 第四级:禁用菌种 | |
| Alternaria sp. | 链格孢属--新增菌种 |
| Aspergillus flavus | 黄曲霉--新增菌种 |
| Aspergillus fumigatus | 烟曲霉--新增菌种 |
| Aspergillus nidulans | 构巣曲霉--新增菌种 |
| Aspergillus ochraceus | 赭曲霉--新增菌种 |
| Aspergillus parasiticus | 寄生曲霉--新增菌种 |
| Aspergillus rugulosus | 细皱曲霉--新增菌种 |
| Aspergillus versicolor | 杂色曲霉--新增菌种 |
| Bacillus anthracis | 炭疽芽孢杆菌--新增菌种 |
| Candida parapsilosis | 近平滑假丝酵母--新增菌种 |
| Candida tropicalis | 热带假丝酵母--安全分级调整,由1级调整为4级 |
| Clauiceps prupurea | 麦角菌--新增菌种 |
| Erwinia sp. | 欧文氏菌 |
| Fusarium sp. | 镰刀菌--新增菌种 |
| Klebsiella oxytoca | 产酸克雷伯氏菌 --新增菌种 |
| Klebsiella pneumoniae | 肺炎克雷伯氏菌 |
| Penicillium chrysogenum | 产黄青霉—新增菌种 |
| Penicillium citrinum | 桔青霉—安全分级调整,由2级调整为4级 |
| Penicillium cyclopium | 圆弧青霉--新增菌种 |
| penicillium marneffei | 马尔尼菲青霉--新增菌种 |
| Penicillium viridicatum | 鲜绿青霉--新增菌种 |
| Pseudomonas aeruginosa | 铜绿假单胞菌 |
| Pseudomonas marginalis | 边缘假单胞菌--新增菌种 |
| Pseudomonas solanacearum | 青枯假单胞菌--新增菌种 |
| Pseudomonas syringae | 丁香假单胞菌--新增菌种 |